El complex museístic va adquirir dos nous pisos superiors, així com una façana de color groc brillant de 8 milions de rajoles ceràmiques. La tasca de l'arquitecte i la direcció del museu era transformar el museu infantil més antic del món (es va inaugurar el 1899) en un centre educatiu modern, centrat no només en el públic infantil i també serveix de "centre comunitari" per als residents de Brooklyn..
L’edifici reformat té una biblioteca, noves sales d’exposicions, cafeteries i aules. La terrassa del terrat amb un teatre d’estiu, existent des del 1970, està ara més estretament connectada amb la resta de l’edifici gràcies a les noves escales i vestíbuls. Baranes i finestres addicionals a un nivell inferior a l’habitual, altres detalls interiors recorden als visitants que aquest edifici està dissenyat principalment per a nens; i que les seves sales estan plenes no només d’artefactes curiosos de les ciències històriques i naturals, sinó també de joguines i atraccions, inclosa una caixa de sorra amb sorra blava.
El Brooklyn Children's Museum es convertirà en el primer museu de l’Estat de Nova York a rebre una certificació d’energia LEED de plata: s’utilitzen pous geotèrmics per escalfar i refredar l’edifici, s’instal·len plaques solars a les façanes i els ecosensors regulen la il·luminació i la ventilació sistemes.
