La Fundació Botín per a les Arts i la Cultura es va construir a l'antiga zona portuària, que durant molt de temps va separar l'Oceà Atlàntic del centre de la ciutat. La situació ha canviat amb l'aparició d'un nou centre cultural a l'aparcament de la terminal de ferri, però els canvis en millor haurien estat molt més modestos si no hagués estat per iniciativa de les autoritats de la ciutat: va amagar una carretera molt transitada (13 milions de cotxes a l'any) en un túnel que passava entre blocs de la ciutat i un moll. Això va permetre estendre els jardins històrics de Pereda fins a la riba de l'oceà: és al seu nou territori on es troba el centre de Botín.
S'eleva sobre el terra sobre suports blancs i està parcialment cobert de verd, per no pertorbar la integritat del paisatge marí que s'obre des d'aquest punt. Amb el mateix propòsit, el volum de l'edifici es divideix en dos "hemisferis", connectats per passadissos i terrasses de vidre i acer. Al mateix temps, l’edifici sobresurt nou metres cap a l’Atlàntic, formant una mena de trampolí.
Les façanes estan cobertes amb 280.000 rajoles de nacre arrodonides que emfatitzen la forma racional de l’edifici. Els extrems dels "hemisferis", que donen a l'oceà i a la ciutat, són vidriats, completament de vidre, i el pavelló d'entrada és l'única habitació situada al nivell del terra. Hi ha un centre d'informació, una botiga de museus, una cafeteria i un restaurant.
A sobre, al "hemisferi" occidental més gran, hi ha dues plantes de sales d'exposicions amb un sofisticat sistema de filtratge de la llum solar als sostres típics dels projectes del taller de construcció de piano Renzo.
A la part est hi ha una sala per a 300 espectadors i un centre educatiu. Es va instal·lar una pantalla LED a la façana occidental i es va construir un amfiteatre per a projeccions de pel·lícules i difusió del que està passant a l'edifici.
La nova part dels jardins de Pereda va ser dissenyada per l’arquitecte paisatgista Fernando Caruncho: durant la reconstrucció, la superfície d’aquest parc de la ciutat ha passat de 20.000 a 48.000 m2 i els espais verds que hi ha, de 7.003 a 20.056 m2. També s’hi va construir un nou centre d’informació turística, segons el projecte de l’oficina Piano.
