El museu, que conté les famoses pantalles bessones "Iris" de l'artista Ogata Korin del segle XVII, a més d'una varietat de pintures, escultures i arts i oficis del Japó, la Xina i Corea, es troba al territori d'una antiga casa pairal. a prop del bulliciós bulevard Omotesando.
El propòsit de la reconstrucció era crear una sensació de "wa" - "harmonia japonesa" per al visitant. La tasca pràctica de Kuma era preservar el caràcter apartat i tancat del complex, tot seguint els principis de l'arquitectura japonesa. El projecte resultant combina els elements individuals i els principis generals de l'arquitectura tradicional amb el llenguatge del modernisme, que simplificava i tipificava detalls i formes.
L’edifici sota una gruixuda teulada a dues aigües, amb destacats suports verticals, va adquirir quasi totalment parets de vidre; això és alhora un homenatge al segle XXI i un reflex de la “permeabilitat” d’una casa tradicional japonesa, la seva estreta connexió amb la natura circumdant. (en aquest cas, amb el jardí). El bambú s’utilitza àmpliament, des de parets i sostres externs fins a bancs i taquilles del traster.
Si es va reconstruir l'edifici principal i es va doblar la mida, la cafeteria del museu es va reconstruir completament. En aquest petit edifici, Kuma va utilitzar el vidre i el paper greixat com a materials principals, reunint modernitat i tradició.
