El museu està situat al complex fabril de Santa Ana: la producció de ceràmica en aquest lloc va començar fa 500 anys i es va detenir només a finals del segle XX. Els arquitectes que van realitzar no només la reconstrucció de l'edifici per a les necessitats de l'exposició, sinó també el disseny de l'exposició, consideren el seu projecte com un "pas més en l'evolució" d'aquesta fabricació.
De la fàbrica d’explotació han sobreviscut 8 forns, un pou, molins per fer pintures, tallers i magatzems. En el transcurs de troballes arqueològiques, es van poder trobar les restes de vuit forns més, els més antics dels quals ja no s’utilitzaven a finals del segle XVI.
Els arquitectes no van voler "declarar" res amb el seu projecte, sinó que només van intentar encaixar en el context històric: per exemple, el seu treball no es manifesta de cap manera a les façanes de l'edifici.
Al llarg de segles de treball actiu, la fàbrica ha estat reconstruïda, renovada i ampliada reiteradament, i avui el seu complex és un mosaic caòtic de fragments de diferents èpoques. Amb l'ajut dels últims mètodes arqueològics, es va poder preservar no només aquest desordre, sinó fins i tot el sutge i la cendra dels segles passats.
El primer nivell de l’edifici s’organitza al voltant dels forns, cosa que fa que l’espai sigui laberíntic; descriu el procés tradicional de fabricació de ceràmica. Les sales d’exposició de la segona planta es troben al voltant del pati. Les façanes d’aquesta part de l’edifici estan protegides del sol amb tubs de ceràmica de producció local: és una referència al tema del museu i una manera de ressaltar visualment la capa més nova del “palimpsest” arquitectònic.
