El nou complex consta de set edificis fabrils de la dècada de 1910 (magatzems, laboratoris i dipòsits de fermentació) i tres edificis nous: el museu (espais per a exposicions temporals), el cinema (sala multimèdia) i la torre de 10 plantes (edificis per a l’exposició) de la col·lecció pròpia de la Fundació Prada; s’obrirà una mica més tard), a més d’un gran pati. De la superfície total de 18.900 m2, 11.000 m2 s’han destinat a exposicions.
En descriure la seva construcció, Rem Koolhaas va assenyalar que l'actual "increïble expansió del sistema artístic" no ha anat acompanyada d'un augment del nombre de tipus d'edificis d'exposició: n'hi ha molt pocs. El tipus més popular, que ha servit els seus edificis industrials, els artistes trien com a opció neutral "per defecte", que no entra en conflicte amb les seves obres.
A diferència de molts altres exemples similars, la planta de Prada al barri Largo Isarco de Milà presenta un “repertori” molt gran de formes i tipus d’espai, sovint contrastants: estret i ample, clar i fosc, obert i tancat. Segons Koolhaas, aquesta varietat d’arquitectura desafiarà l’art i contribuirà a la creació de projectes originals.
A més, l’arquitecte es va dedicar al tema de la conservació del patrimoni, que encara li interessa. Considera que el seu projecte no és ni una "conservació", ni un edifici nou, sinó una cosa entremig. La interacció constant d'aquests dos "estats" no permetrà que parts de l'estructura es fusionin en una sola imatge, o en un dels seus components, per guanyar la supremacia sobre la resta.
En general, el complex, malgrat el seu client "luxós", té una solució bastant modesta. Només un dels edificis, cobert de daurats, crida l'atenció des de lluny (Koolhaas afirma que aquesta solució de façana és més assequible que el marbre o fins i tot la pintura). A més, s’utilitzava escuma a base d’alumini per a les façanes i els interiors.
A més del desenvolupament del projecte arquitectònic, OMA també va actuar com a autors del disseny de la primera exposició al complex de Milà. Serial Classics (a cura de Salvatore Settis) explora la controvertida relació entre autenticitat i imitació a l'antiga Roma a través de les moltes còpies romanes de l'escultura grega que es poden veure com un homenatge a la cultura grega.
L’entrada de la Fundació Prada té un restaurant dissenyat pel cineasta Wes Anderson i una zona infantil dissenyada per estudiants de l’Escola d’Arquitectura de Versalles.
